2024年诺贝尔生理学或医学奖授予了维克多·安布罗斯和加里·鲁夫昆,以表彰他们发现microRNA及其在基因调控中的作用。microRNA对癌症早期筛查具有重要意义,特别是在开发利用microRNA作为生物标志物的诊断技术方面。 对于癌症早筛,上月康圣环球以总代价3130万美元(折合人民币约2.2亿元)收购肿瘤早检企业基准医疗100%股权权益。2018-2023年,燃石医学分别净亏损1.78亿元、1.69亿元、4.07亿元、7.97亿元、9.71亿元和6.54亿元,合计超过30亿元;2018年至2022年,泛生子分别亏损4.65亿元、6.76亿元、30.69亿元、4.96亿元、8.11亿元,累计超过55亿元。 MicroRNA(miRNA)是小型RNA分子,在基因表达调控中起着关键作用。由于其在血液和其他体液中的稳定性,miRNA已成为早期癌症检测的有前景的生物标志物,使其成为理想的无创检测工具。详细介绍可参考以下思维导图,在此不再赘述,本文重点介绍microRNA癌症早筛产品开发。 来源:生科创工坊,点击查看大图 识别miRNA生物标志物 研究并识别能够指示早期癌症的特定miRNA 来源:KEGG,点击查看大图 近10年miRNA研究论文统计 高引用论文 - Bartel, D. P. (2009). MicroRNAs: Target Recognition and Regulatory Functions. Cell, 136(2), 215–233.
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研究基因研究云图 技术评估 市场现有产品 miRNA检测方法对比 评估当前用于miRNA检测的技术及其在试剂盒中的适用性 当前技术 - 定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR):qRT-PCR因其高灵敏度和特异性而著称,适用于检测各种生物样本中低丰度的miRNA。该方法包括将miRNA逆转录为cDNA,随后进行扩增和定量。由于其稳健性和定量能力,qRT-PCR被广泛采用。
- 微阵列分析:微阵列可以同时对数千种miRNA进行分析,提供miRNA表达模式的全面概览。这种高通量方法有助于发现新的miRNA生物标志物并理解其在不同癌症类型中的作用。然而,与qRT-PCR相比,其灵敏度可能较低,且成本通常较高。
- 下一代测序(NGS):NGS在miRNA分析方面提供了无与伦比的深度,能够高精度地检测已知和新发现的miRNA,并识别miRNA变体。尽管具有上述优势,NGS成本较高且数据分析复杂,可能限制其在常规诊断试剂盒中的应用。
- 数字滴度PCR(ddPCR):ddPCR通过将样本分割成数千个液滴,提高了miRNA定量的精确性,实现了无需标准曲线的绝对定量。其灵敏度和重复性高,但与其他方法相比,通量较低。
试剂盒适用性评估 - 灵敏度和特异性:诊断试剂盒必须能够可靠地检测低丰度的miRNA,并尽量减少假阳性。qRT-PCR和ddPCR在这方面表现出色,是临床环境中的合适选择。
- 通量和可扩展性:对于大规模筛查,微阵列和NGS提供了高通量能力。然而,对于特定癌症相关miRNA的靶向分析,qRT-PCR仍然是首选。
- 成本和可获取性:成本效益对于广泛的临床应用至关重要。qRT-PCR在成本和性能之间取得了平衡,而NGS和微阵列的高成本可能限制其在常规诊断中的应用。
- 易用性和集成性:诊断试剂盒应易于使用并能轻松集成到现有的实验室工作流程中。基于qRT-PCR的试剂盒通常较为简便实施,而NGS需要专业设备和技术。
设计试剂盒的原型 试剂盒的组成 1. 样本采集与处理: - 样本类型:血浆、血清或其他相关体液。
- 采集设备:标准化管子,配有防腐剂以保持miRNA的稳定性。
- RNA提取模块:高效的miRNA分离协议,确保高产量和纯度。
2. miRNA检测模块: - 检测方法:qRT-PCR用于靶向miRNA的定量。
- 试剂:逆转录试剂盒、特异性针对选定miRNA的SYBR Green或TaqMan探针。
- 板材及消耗品:预填充的反应板,减少污染和变异。
3. 数据分析与解读: - 软件集成:用户友好的数据分析软件,用于归一化和解读。
- 生物标志物Panel:预定义的miRNAPanel,关联特定癌症类型,确保准确诊断。
4. 质量控制: - 内部对照:加入外源性对照以监测提取和扩增效率。
- 校准标准:用于定量和确保批次间的一致性。
工作流程 1. 样本采集:使用标准化采集设备收集并稳定患者样本。 2. RNA提取:使用RNA提取模块分离miRNA,确保高纯度和高产量。 3. 逆转录与扩增:将miRNA转化为cDNA,随后使用特异性探针通过qRT-PCR进行扩增。 4. 数据分析:通过集成软件分析扩增数据,确定miRNA表达水平并生成诊断报告。 最后 对于miRNA基于癌症早期检测试剂盒的开发,qRT-PCR因其高灵敏度、特异性、成本效益和易于集成到临床工作流程中,成为最合适的检测方法。尽管微阵列和NGS提供了全面的分析能力,但其较高的成本和复杂性使其在常规诊断中的应用受到限制。将qRT-PCR纳入试剂盒设计,确保了miRNA生物标志物的可靠和高效检测,促进了癌症的早期诊断和改善患者预后。诺奖这波热度会带来更多产品的惊喜么? 来源:小桔灯网 |