能这么欢乐的吃瓜，不愧是欢乐喜菌人——前言2024年1月，国家卫健委临检中心启动了《中枢神经系统感染宏基因组高通量测序室间质量评价预研》。7月29日，结果出来了。一共139家实验室参与，127家回报有效结果，45家满 ...
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能这么欢乐的吃瓜，不愧是欢乐喜菌人 ——前言 2024年1月，国家卫健委临检中心启动了《中枢神经系统感染宏基因组高通量测序室间质量评价预研》。 7月29日，结果出来了。 一共139家实验室参与，127家回报有效结果，45家满分。 拿了满分的自然是“喜报呈上”，没拿到的则“沉默不语”。 结合这次的结果和一些场外信息，我们也可以好好的吃个瓜
PS：本文仅为个人观点，如有得罪，欢迎留言区贴脸开大。 01消失的“TA” 127家回报有效结果，45家满分。 换句话说，有82家没拿到满分。 “满分不少见，缺谁谁尴尬” 当然，也不一定是没拿满分——没报名也是有可能的。
广州金......金域去哪儿了？ 杭州迪......迪安去哪儿了？ 不过对于ICL来说，mNGS本身倒也不是强项，就算是真没拿满分，大意失荆州也勉强可以理解。 那把mNGS当安身立命之根本的玩家们，应该没问题吧？
杭州微.......微岩去哪儿了？ 没看错的话，这是传统五虎里面唯一的“缺席虎”，扎心了老铁。 五虎缺一虎怎么办？ 杰毅，站了出来。 虽然报名要求中明确要求“同一家公司仅允许一家实验室报名” ——但，杭州杰毅从名字上来说关我重庆基拯什么事儿。 别问，问就是在帮微岩补位 ——说好了五虎，那必须有五家实验室整整齐齐。 “五虎的荣光，由我来守护” 02 炸裂的“拉胯” 众所周之，随着mNGS竞争进入白热化，“入院”是兵家必争之地。 45家满分实验室中，有32家属于医院的院内实验室。 ——这32家的技术平台都是跟谁合作的？ 结果这一合计，又有人要被“公开处刑”了..... 我搜集了下公开发言的四家官方表述（之前漏了予果的喜报是我的错...）： 假设大家都没撒谎 ——微远保底贡献21家满分（20+的起点是21没毛病吧），杰毅保底贡献3家满分（“多家”的起点是3这个没疑问吧），微岩保底贡献1家满分（毕竟它自己没拿到）。 “小学生都知道，32-21-3-1=7” 留给院内实验室的满分名额最多只剩7家。 也就是说，金匙合作的30家医疗机构，至少有23家没有拿到满分。 扣分率76.6%起步...... 放眼整个共建界这也是非常炸裂的存在了。 当然，事物都有两面性，这至少说明金匙很老实——没有在体系内“对答案”。 像下面这两家把“对答案”玩成“抄袭”的，那就不仅仅是水平上的炸裂了。 要么有人在撒谎，要么有人真拉胯。 当然这也给各位PR伙伴上了生动的一课： “没事别瞎发细节，不说话也许真没事” 03 满分的“拦路虎” 回到此次室间质评的结果上，有哪些题是大家最容易做错的？
来自于2024S13这个混合感染样本，病原体为单纯疱疹病毒1型和肺炎链球菌，要求准确报告病原体。 从“检测”的角度，不难。 难点在于临床： 社区获得性中枢神经感染一般以单一感染为主，混合感染少见，HSV-1和肺链的混合感染更是少之又少。 检出后报不报，很考验报告组的临床积累及判断。 听说某大厂就是“检出了”但在结合临床的判断中选择了“不报”，喜提-5分。 当然，TA并不孤单，总共有76家在这里栽了跟头。 光是“漏报HSV-1”的，就有71家。 要知道一共只有82家没拿满分。 这些“漏网之鱼”是被哪个病原体补刀了？
总共被漏了66次，尤其是浓度较低的2024S12样本，仅有102家检出。 听说某大厂就是躲过了上面的“单纯疱疹病毒1型”之坑，却在这一项马失前蹄。 喜提“答对S13样本的非满分选手”称号。
但可以被技术性“消除”。 有 11 家实验室报告了假阳性微生物，其中两家实验室的假阳性情况严重，分别报告了32个和122个假阳性结果。 “恰好”这两家没有建立背景微生物数据库，且没有参考提供的阴性质控结果。 在污染无法从源头避免的情况下，通过建立背景微生物数据库来技术性“消除”，需要成为每一个mNGS实验室的规定动作。 “去污，才能存真” 04“标准”的暗战 当然，此次只是预研 ——拿了满分的再接再厉，没拿满分的及早发现问题也不是坏事。 总比到临床真刀真枪的时候出错报告要强。 这一次的“竞争”也不止是“满分与否”，桌面下的暗战是“话语权”。 上一次聊tNGS的时候，有提到标准之争。 这次的室间质评有一个很有意思的细节： 微远基于传统宏基因组技术的IDseq Prime和基于探针捕获的IDseq Ultra都参加了。 而根据预研报名通知中的描述： 探针捕获一定是做了预先假设的——不然怎么设计探针呢？ 微远，在擦一种很新的边。 探针捕获，究竟是mNGS 2.0还是tNGS Max？ 它预设的竞争对手，是谁？ 来源：有趣的胖子万里挑一 |
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