Illumina 之外的测序技术公司正在努力抢占低通量端市场的一块份额，提供新的仪器和试剂，这些仪器和试剂将改变研究经费的分配和花费。

本月早些时候，华大智造（在美国以Complete Genomics 名义开展业务）宣布，最近推出了针对中低通量 DNBSEQ-G99 的双端 300 bp 试剂盒，并将很快推出单端 400 bp 试剂盒。

周四，Element Biosciences 宣布了几款新的测序试剂套件，包括用于 2x150 bp 测序的 2.5 亿读取试剂盒和用于 2x300 bp 测序的 1 亿读取试剂盒，以及锁定的低价版本的 Aviti 测序仪（不能运行该公司的高通量流通池，尽管可以升级）。

除此之外，Singular Genomics G4 仪器可运行单个 1.5 亿读数 F2 流动池，具有四个可单独寻址的通道，这些选项对 Illumina 在这一低端测序市场的主导地位构成了挑战，尤其是 MiSeq，这是一款低通量主力产品，运行流通池可产生 200 万至 5000 万次读数。

Element 测序应用副总裁 Shawn Levy 表示，该公司的新选项是为了响应客户的反馈。“他们希望以较低的价格获得较低的通量，”他说。“他们对每次运行的成本比每Gb的成本更感兴趣。这是有关开机的成本。”

Element 的 2x300 bp 试剂盒售价为 1,680 美元，而最相似的 MiSeq 试剂盒的标价为 1,887 美元，“问题是，我还需要运行我的 MiSeq 吗？” 最近购买了 G4 的佛蒙特大学高级基因组实验室的技术总监Scott Tighe 说道。

尽管过去几年测序公司专注于高通量和中通量仪器，但低通量市场继续推动布局。2022 年， Illumina 发货了约 1,670 台低通量仪器，其中近 700 台交付给了新客户。而同年，Illumina 发货了 1,215 台中通量仪器。较低的仪器价格和较低的消耗品拉动使得它的利润可能不如NGS的高端市场那么可观（主要由 Illumina 的 NovaSeq 系列提供）。但对于许多学术实验室（包括核心设施）来说，可以开展小规模实验的能力仍然很重要。

“对于试点项目、初步研究和深度测序前的质量控制来说，这些低通量技术是关键，”威尔康奈尔医学院的测序专家 Chris Mason 说。“它们满足了市场和实验室的需求，使科学变得更好更快。”

华大智造一年前推出了G99，宣称运行时间仅为 7 小时。公司的一位发言人在一封电子邮件中表示，G99已经在 16 个国家销售。华大智造的2x300 bp试剂盒主要用于16s微生物测序，现已在中国上市，并将于今年晚些时候在美国上市。400 bp 试剂盒还将具有至少 8000 万个读数。

Singular 将其G4设计为能够从市场中间向上或向下延伸，并于去年开始发货。单个 F2 流通池的价格约为 600 美元，提供了每次运行的最低成本之一，尽管它无法实现 2x300 bp 运行。

Element 的 Levy 表示，灵活性是新产品背后的驱动力，而不是专门针对低通量的需求。

Daicel Arbor Biosciences 的研发经理 Jacob Enk 在一份声明中表示，“Aviti 上流动池功能的更通用组合意味着我们可以将几乎所有常规测序活动（NGS 服务、产品质量控制和研发）迁移到单一仪器和工作流程上，没有复杂批次管理的物流问题。”

尽管如此，Element 的新产品还是引起了对小样本量运行感兴趣的潜在客户的兴趣。“我们已经计划为我的实验室购买 Aviti，这加速了这个愿望，”Mason说。

Element 还将所谓的 Aviti LT 的标价从 290,000 美元降至 210,000 美元。这些仪器可以升级以运行更高通量的流动池，价格为 99,000 美元。

“价格几乎是最重要的部分，” Medio Labs（一家致力于基于 NGS 的病原体检测的初创公司）的基因组学总监 Shana McDevitt 说。目前，Medio 的技术使用 Illumina MiniSeq 平台，该仪器的通量甚至比 MiSeq 还要低。“我对到热带岛屿度假感到非常兴奋，但如果我买不起飞机，我还是留在原地，”她打比方说道。

然而，一些人认为，测序公司的投入可能还不够大。Medio 的 McDevitt 表示，1 亿次读取的流动池是“我们的最佳选择”，但这可能还是超出了其他应用程序的需求。“除了另一场大流行之外，我不知道有哪个病原体检测panel你需要快速制备或拥有足够的样本来满足这么高通量的运行，至少在我们的技术上是这样。”

威尔康奈尔大学的Mason补充说，即使是 2500 万至 5000 万个更小的流动池也可用于试点项目、小型基因组和质量控制。

“如果有一个用于 QC 的小型流动池就好了，”Tighe 说。“我不想花 600 美元来确定一个文库制备的好不好。”

Tighe 指出，MiSeq 应该能够保留大量的低通量市场，这对于一些验证应用来说至关重要，例如临床和法医应用。他说，对于新进入者来说，蚕食这个堡垒“将是一项艰巨的任务”。

新产品将如何转化为销售——尤其是仪器的投放——还有待观察。如果 Illumina 有降低价格的计划，（该公司目前将保留这一计划，）这表明竞争可能会持续下去。

“我认为人们的假设是低通量测序正在消失，”Element 的Levy说。“这不是我们看到的反馈。”

Singular 首席执行官兼联合创始人 Drew Spaventa 对此表示同意。 该公司最近发布了更大的 F3 流通池。“我们认为我们的两个客户会迁移到 F3，但他们仍在订购 F2，”他说。

参考原文：

https://www.genomeweb.com/sequencing/ngs-firms-pursue-slice-low-throughput-market 

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